Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG3P32926 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG3P32926 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DSG3P32926 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG3P32926 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG3P32926 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms