Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF1P30408 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF1P30408 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms