Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A5P29400 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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