Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PLNP26678 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PLNP26678 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PLNP26678 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms