Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms