Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VAMP1P23763 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms