Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MYF6P23409 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MYF6P23409 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MYF6P23409 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms