Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB3BP20337 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB3BP20337 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms