Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR1P18146 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms