Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFAP15692 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms