Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC172P0C7W6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC172P0C7W6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms