Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C4AP0C0L4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms