Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB1P08034 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB1P08034 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB1P08034 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB1P08034 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB1P08034 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB1P08034 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB1P08034 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB1P08034 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB1P08034 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms