Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFNA17P01571 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFNA17P01571 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA17P01571 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA17P01571 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA17P01571 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA17P01571 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFNA17P01571 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms