Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCNTO95613 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCNTO95613 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCNTO95613 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCNTO95613 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCNTO95613 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNTO95613 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNTO95613 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNTO95613 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCNTO95613 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms