Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOBTB3O94955 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms