Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNND1O60716 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNND1O60716 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms