Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms