Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms