Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNJ1O43426 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ1O43426 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ1O43426 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms