Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS3O14543 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms