Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE40O14503 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms