Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AGRNO00468 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGRNO00468 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGRNO00468 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGRNO00468 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms