Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
J3KT08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
J3KT08 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
J3KT08 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms