Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SDR42E2A6NKP2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SDR42E2A6NKP2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms