Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MBD3L3A6NE82 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms