Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C5orf51A6NDU8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C5orf51A6NDU8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms