Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MCM3AP-AS1-201ENST00000414659 2539 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC037487.1-201ENST00000583416 2474 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL731563.3-201ENST00000608005 3005 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SYNPR-212ENST00000479198 2436 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC01847-203ENST00000641163 1490 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 XRCC6P1-201ENST00000420392 1805 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PTH-201ENST00000282091 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SPRR3-201ENST00000295367 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CLEC2A-201ENST00000339766 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 UBE2C-205ENST00000372568 914 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNU1-28P-201ENST00000383861 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNU1-27P-201ENST00000383869 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNU1-1-201ENST00000383925 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNVU1-18-201ENST00000384010 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNU1-2-201ENST00000384278 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNU1-4-201ENST00000384659 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RAET1M-201ENST00000405282 596 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC02246-201ENST00000412426 991 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC011228.1-201ENST00000439027 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC01937-201ENST00000448543 553 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC003075.1-206ENST00000448664 541 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 DNAJC9-AS1-202ENST00000457147 762 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ARHGAP31-AS1-201ENST00000466292 624 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RN7SL370P-201ENST00000470869 295 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RN7SL397P-201ENST00000487309 298 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC02116-201ENST00000509455 493 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RBM4B-207ENST00000531969 769 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL591767.2-201ENST00000554984 173 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC02152-201ENST00000566208 1281 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 DYNLL1P3-201ENST00000596113 266 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LAMTOR5-AS1-211ENST00000598350 749 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CR769775.3-201ENST00000610388 219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 U1.40-201ENST00000610976 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL513479.1-201ENST00000611376 585 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 HOXA11-AS1_2.1-201ENST00000615604 187 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC244093.2-201ENST00000620102 524 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CR381653.1-205ENST00000623409 580 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 FANCB-201ENST00000324138 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MYLK-220ENST00000578202 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SORCS1-203ENST00000369698 2638 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 OR7E24-201ENST00000456448 1550 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC105233.5-202ENST00000642083 4132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TCF4-207ENST00000540999 2572 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 AC138904.1-201ENST00000501520 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CASP5-202ENST00000393141 1488 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 LINC00920-201ENST00000499966 2147 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMEM225BP0DP42 CNFN-201ENST00000222032 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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