Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HDGFL3Q9Y3E1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDGFL3Q9Y3E1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms