Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms