Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GINS2Q9Y248 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms