Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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