Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNH4Q9UQ05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNH4Q9UQ05 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms