Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PHF8Q9UPP1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms