Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHA12Q9UN75 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2669.2 ms