Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNPO2Q9UMS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms