Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH9Q9ULB4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH9Q9ULB4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms