Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNMA3Q9UL41 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms