Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP4Q9UKK3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms