Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP2BPQ9P2M1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP2BPQ9P2M1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms