Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CC2D2AQ9P2K1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms