Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSRB1Q9NZV6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSRB1Q9NZV6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSRB1Q9NZV6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSRB1Q9NZV6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSRB1Q9NZV6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSRB1Q9NZV6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms