Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKIRAS1Q9NYS0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms