Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms