Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLCO1C1Q9NYB5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1C1Q9NYB5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms