Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms