Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM1Q9NRU3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms