Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A4GALTQ9NPC4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4GALTQ9NPC4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms