Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms