Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF3Q9H4D5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms